يتشكل هيكل المعهد على النحو التالي:
*عمادة المعهد:
1.العميد
2.نائب العميد للشئون الأكاديمية
3.نائب العميد لشئون الفروع
4.نائب العميد للشئون المالية والإدارية
* مجلس المعهد
ويتكون من:
1.عميد المعهد وهو رئيس مجلس الإدارة
2.نائب العميد لشئون الفروع
3.نائب العميد للشئون المالية والإدارية
4.مدراء الدوائر الأكاديمية
5.ممثل عن أعضاء هيئة التدريس بالمعهد